Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gipc3Q8R5M0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms