Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1mtQ8R4U6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1mtQ8R4U6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms