Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r212Q8R268 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r212Q8R268 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms