Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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