Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TprkbQ8QZZ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms