Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mcfd2Q8K5B2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcfd2Q8K5B2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms