Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vrk3Q8K3G5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vrk3Q8K3G5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vrk3Q8K3G5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vrk3Q8K3G5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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