Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms