Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sash3Q8K352 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sash3Q8K352 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms