Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssh3Q8K330 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ssh3Q8K330 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ssh3Q8K330 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ssh3Q8K330 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ssh3Q8K330 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssh3Q8K330 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ssh3Q8K330 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ssh3Q8K330 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ssh3Q8K330 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms