Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nsl1Q8K305 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms