Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms