Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms