Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Fcho1Q8K285 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Fcho1Q8K285 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Fcho1Q8K285 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcho1Q8K285 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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