Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcf3Q8K268 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms