Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms