Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh2d5Q8JZW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms