Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc4a8Q8JZR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc4a8Q8JZR6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms