Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms