Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf628Q8CJ78 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms