Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwnkQ8CIW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwnkQ8CIW5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwnkQ8CIW5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwnkQ8CIW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwnkQ8CIW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms