Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc43a2Q8CGA3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc43a2Q8CGA3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms