Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4lQ8CFI0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms