Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms