Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms