Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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