Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms