Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A430089I19RikQ8C9W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A430089I19RikQ8C9W1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms