Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spef2Q8C9J3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef2Q8C9J3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms