Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms