Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms