Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot2Q8C5L3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot2Q8C5L3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms