Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc60Q8C4J0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms