Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C1R3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms