Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Usp47Q8BY87 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Usp47Q8BY87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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Usp47Q8BY87 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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