Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms