Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx1bQ8BX32 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms