Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms