Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms