Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprnQ8BWU1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SprnQ8BWU1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms