Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Catsper4Q8BVN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Catsper4Q8BVN3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms