Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdhaf4Q8BTE0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms