Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3Q8BRE0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3Q8BRE0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms