Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gga3Q8BMI3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms