Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms