Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem87bQ8BKU8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms