Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmd4aQ8BIE6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmd4aQ8BIE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms