Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms