Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms