Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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